9月3日。小說站
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美國西海岸（加利福尼亞州外海）人工島城市•學芸都市。
白天——
因為學院都市組織的廣域社會調查的活動，御阪美琴、白井黑子、初春飾利、佐天淚子四人來到了美國的學芸都市。
四人在島上與白人女導演畢芭利•希斯露相識。
從海中突然出現的一架奇異的飛行器與學芸都市的空中防衛隊“拉碧塞飛行隊”進行戰斗，美琴在其中使用能力保護普通游客。
奇異的飛行器在戰斗中被擊毀。
晚上——
對白天的事件充滿疑問的美琴決定去探索學芸都市的秘密。
美琴以及偶然跟著她的佐天兩人潛入到了影視設施“LargeLauncher（大發射架）”內部，並見到了白天所擊毀飛行器“雲海之蛇”的殘骸。
兩人在設施內部遭遇“工作人員”奧莉弗•赫麗德，不過奧莉弗卻遵照上層的指示將兩人放走。
9月4日。
白天——
在賓館內的美琴一早就受到白井黑子（穿著學院都市特制泳衣）的騷擾。
獨自在外面的佐天淚子被“雲海之蛇”的駕駛員席琪桃爾抓住，受到她的威脅而去商店買泳衣。
買泳衣途中的佐天與畢芭利•希斯露偶遇，最後在畢芭利的推薦下，佐天給席琪桃爾買了一件非常顯眼的寶石比基尼。
“雲海之蛇”再次襲來，席琪桃爾的同僚托琪托莉出現並將席琪桃爾帶回。栗子網
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晚上——
美琴、黑子、白井三人品嘗著晚飯後的甜點。
帶著對一系列事件的疑問，佐天淚子決定重回“LargeLauncher（大發射架）”內尋求答案。
佐天剛要窺探到設施內部隱藏區域的時候就被“工作人員”奧莉弗逮住。
9月5日
白天——
因為擔心徹夜未歸的佐天安危，美琴三人在擁有“讀心能力”的風紀委員幫助下得知了佐天的去向。
奧莉弗在上層的指示下準備將佐天淚子秘密“處理掉”。
在最危急時刻下的佐天被乘坐“雲海之蛇”而來的席琪桃爾所救，並告知佐天自己隸屬的組織（有翼者的歸還）即將利用“太陽之蛇（魔法兵器）”發動對學芸都市的毀𩢤]源蚧鰲 br />
晚上——
安然回到賓館的佐天在自己的房間休息，並將自己的所見所聞告知給了三人。
奧莉弗•赫麗德帶領特種兵突襲了佐天的房間，不過卻被美琴和白井擊潰。
在美琴的請求下，奧莉弗答應疏散滯留在學芸都市的全部游客。
學芸都市的高層“經營團隊”五人受到了亞雷斯塔的警告。
9月6日。
避難警報拉響，學芸都市的游客開始登上大型救生艇“紅鮭”上逃亡。
學芸都市“拉碧塞飛行隊”與“有翼者的歸還”展開全面戰斗，美琴和白井兩人則準備擊毀“太陽之蛇”。小說站
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在美琴與黑子的攻擊下，從天空俯沖而來的三架“太陽之蛇”被毀，但最後也是最具破壞力的第四架“太陽之蛇”卻從天而降。
在乘坐“雲海之蛇”席琪桃爾的攻擊下，美琴與被擊暈的黑子困在了一架處于下落中的“太陽之蛇”殘骸上面。
通過發動能力對水分子的操控，美琴成功的制造出了一對“水之翼”，並帶著白井脫離險境。
在空中的美琴追上席琪桃爾以及最後一架“太陽之蛇”，兩人隨即展開激戰。
在美琴一擊漂亮的“超電磁炮”攻擊下，最後一架“太陽之蛇”開始解體。
“太陽之蛇”所落下的殘骸致使身處地面的佐天淚子陷入危險，席琪桃爾見狀則駕駛著“雲海之蛇”趕去營救。
在佐天的懇求下，席琪桃爾放棄任務，和自己的同僚托琪托莉前去阻止其他同僚攻擊救生艇“紅鮭”的行動。
戰斗結束後的美琴四人乘坐飛機離開了學芸都市。
不知何時，席琪桃爾與托琪托莉準備前往組織（有翼者的歸還）的審判庭，接受組織對兩人的審判。
9月8日
上午——
英國•倫敦•聖喬治大教堂（英國清教“必要之惡教會”根據地）
英國清教第零聖堂區“必要之惡教會”最高主教——蘿拉•斯圖亞特告知史提爾，亞雷斯塔所著的一本魔法原典“法之書”以及能破解此書的羅馬正教修女奧索拉•阿奎納被日本本土教派天草式十字淒教所劫走。另外，原擔任此教派的女教皇神裂也不知所蹤。
下午——
日本•東京•學院都市第七學區
茵蒂克絲在與土御門舞夏的談話時被史提爾帶走，並留下字條要上條前往都市外面的廢棄劇院‘薄明座’遺址。
學院都市外部區域
在‘薄明座’遺址的史提爾以及茵蒂克絲兩人與羅馬正教派遣支援的修女雅妮絲•桑提斯相見。
上條帶著在路上偶然結識的脫線修女奧索拉•阿奎納趕往‘薄明座’遺址。
在遺址中的眾人相見，不過奧索拉•阿奎納卻被突然出現的天草式劫走。
黃昏——
二十一名英國騎士派的騎士秘密登陸日本海岸，但一上岸時就遭到了神裂火織毀𩢤]源蚧鰨 北換髟危 劣 潘婧蟾俠瓷坪蟆 br />
晚上——
雅妮絲•桑提斯帶領自己的羅馬正教修女部隊“雅妮絲部隊”進行整備，準備與上條等人突襲天草式要前往的特殊移動魔法“縮圖巡禮”的“渦點”，解救奧索拉•阿奎納。
晚上十一點，營救計劃正式開始，眾人來到某游樂園內與天草式十字淒教進行戰斗。
戰斗中，上條救出奧索拉•阿奎納，並給她帶上英國清教的十字架。（奧索拉從此受洗禮，改信英國清教）
上條與史提爾合力打倒了天草式的代理教皇建宮齋字，戰斗結束。
在建宮齋字的述說下，上條對“雅妮絲部隊”救人的目的產生疑問。
由于提出想再見一面奧索拉•阿奎納，上條、茵蒂克絲與露琪亞和安潔莉娜發生戰斗，兩名修女戰敗後自行離開。
9月9日
清晨——
上條、茵蒂克絲、史提爾、建宮齋字四人各自分別，上條準備獨自前往未完工的“奧索拉大教堂”解救奧索拉•阿奎納。
上條打破“奧索大教堂”的結界，史提爾、茵蒂克絲以及天草式的眾人趕到，並與“雅妮絲部隊”展開激戰。
戰斗中，茵蒂克絲施展的“魔囖楚@簟毖怪譜×舜蟛糠值男夼 匆蚵蘼碚 痰男夼 隕憊セ鞔療譜約旱畝 ざ 獾椒椿鰲 br />
獨自一人從混戰中脫身的上條與“雅妮絲部隊”的首領雅妮絲•桑提斯爆發激戰。史提爾的必殺技“獵殺魔女之王”經過天草式眾人的改進，足以壓制住其他的修女們了。
因為首的雅妮絲被上條擊倒，“雅妮絲部隊”眾人投降，戰斗結束。
早上——
被送往學院都市醫院的上條醒來，見到來探視他的神裂火織。
以上，是來自精靈們的匯報，對這幾天發生的事情的匯報。
“原來如此，這幾天就發生了這麼多的事情嗎？”通過使役存在于世界，可以說是無處不在的精靈們，奈落可以知道任何自己想知道的事情，因為這幾天他一直悶在家里做一些事情，所以，並沒有去關注外界發生的事情，也因此，他才會在空余時間向精靈們索要這幾天所發生的事情的情報。
“辛苦你們了，多謝。”
說完這句話之後，環繞在奈落身邊的濃密到幾乎具現化變成藍色光帶的精靈們紛紛散去。